NFS:Network File System 是已故的Sun公司制定的用于分布式访问的文件系统，它的本质是文件系统。主要在Unix系列操作系统上使用，基于TCP/IP协议层，可以将远程的计算机磁盘挂载到本地，像本地磁盘一样操作。
samba是Unix系统下实现的 Windows文件共享协议-CIFS，由于Windows共享是基于NetBios协议，是基于Ethernet的广播协议，在没有透明网桥的情况下（如VPN）是不能跨网段使用的。它主要用于unix和windows系统进行文件和打印机共享，也可以通过samba套件中的程序挂载到本地使用。
FTP的目的是在Internet上共享文件而发明的一种协议，基于TCP/IP。世界上绝大多数系统都会有支持FTP的工具存在，通用性很强。目前少有人把VFS修改成支持FTP组件的形式，主要是因为FTP一开始就不是为了文件系统而设计的。
三种协议虽然都可以支持文件共享，但是其功能点和侧重点上面各有所不同，协议格式不同。Authentication（鉴定）也就是你说的登陆方式也会随着协议的内容也有所不同。
标准的FTP协议的登陆密码是用明文传输的，没有加密，这会有很大的安全隐患，目前有FTPs(FTP on SSL/TLS)和sFTP(SSH FTP)等基于通信层进行加密的FTP协议，这样会有更好的安全性。
NFS的鉴定机制是基于IP地址的，没有密码这种东西。是控制本地映射的用户权限来控制访问者的权限。
samba和windows那个是基本一致的。不过我不太熟悉，就不妄言了