如果你的女友肚子疼还在上班，你可以尝试以下几种方式来安慰她：
表达理解和关心：让她知道你理解她的痛苦，并真心关心她的身体状况。可以告诉她：“你辛苦了，肚子疼还去上班，一定要保重身体。”
提供实际帮助：如果条件允许，你可以前往她的工作地点，给她送去一杯热水、暖宝宝或者药，帮助她缓解疼痛。
远程陪伴和安慰：如果无法亲自前往，你可以通过电话、短信或者视频通话与她保持联系，询问她的情况，让她知道你在关心她，并给予一些鼓励和支持的话语。
提醒她照顾自己：让她知道你希望她能好好照顾自己，尤其是在身体不适的时候。可以提醒她要注意饮食、休息和保暖等方面。
给予爱的鼓励：不要忘记告诉她你爱她，并鼓励她要坚强。可以告诉她：“疼在你身上，也疼在我心里。要记住，我们永远在一起。”
总之，在这个时候，你的女友需要感受到你的关心和支持。通过以上几种方式，可以让她感到温暖和安慰，帮助她度过难关。